53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1866 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  32.02 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  29.57 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  27.27 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  26.61 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  30.97 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  30.97 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  24.9 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  26.29 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  27.36 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  24.39 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  24.38 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  29.11 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  24.15 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  32.53 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  27.39 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  30.72 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1678  putative phage repressor  28.22 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 240 aa  52  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  25.79 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  30.05 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  24.26 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  26.81 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  36.63 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  25.41 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  23.33 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  29.89 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  22.22 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  23.98 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  22.86 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  33.09 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  22.71 
 
 		 203 aa  46.6  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  30.97 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  22.56 
 
 		 209 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  23.33 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  28.21 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  26.41 
 
 		 247 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  28.39 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  25.97 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  32.32 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  25.95 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  24.19 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  22.75 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  29.91 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  24.09 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 198 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 128 aa  42.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  27.7 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0038  Helix-turn-helix domain protein  28.99 
 
 		 120 aa  42  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000109438  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  26.84 
 
 		 247 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>