250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0130 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  60.19 
 
 		 216 aa  248  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 212 aa  235  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  55.88 
 
 		 209 aa  218  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  54.41 
 
 		 209 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  26.58 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4206  transcriptional regulator, XRE family  37.21 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000156355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4345  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.759199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  28.23 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  25.41 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  24.89 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  25.94 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0038  Helix-turn-helix domain protein  37.88 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000109438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  26.29 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  25.23 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  26.19 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  26.27 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  29.14 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  27.39 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.61 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.59 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  32.18 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.79 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  29.94 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  28.04 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1481  peptidase S24, LexA repressor  30.38 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.939319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  31.76 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  37.93 
 
 		 253 aa  52.8  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  31.62 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  26.24 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  29.63 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  29.83 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0572  repressor LexA  34.4 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0263209 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  27.41 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  27.41 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  27.41 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.48 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  22.83 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 477 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  33.09 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  30.61 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  35.94 
 
 		 472 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  33.33 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  38.46 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0929  LexA repressor  29.41 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  22.91 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  41.54 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  32.62 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  41.54 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  32.56 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  25.94 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  36.23 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  23.98 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  25.94 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  27.45 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19141  SOS function regulatory protein, LexA repressor  30.28 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.212915 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  31.75 
 
 		 239 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  34.12 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  28.07 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  32.86 
 
 		 252 aa  48.1  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  26.07 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  33.33 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 474 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  25.83 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 464 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  33 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.99 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  29.27 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2454  LexA repressor  27.86 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212024  normal  0.397716 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 466 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  28.85 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  25.53 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  32.89 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  30.16 
 
 		 819 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  38.1 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.59 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04340  predicted transcriptional regulator  36.84 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  31.71 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  24.76 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  30.34 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.08 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  35.63 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16801  SOS function regulatory protein, LexA repressor  32.11 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1827  hypothetical protein  24.86 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  28.38 
 
 		 477 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  28.38 
 
 		 477 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0828  SOS function regulatory protein, LexA repressor  32.11 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  26.21 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  32.18 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  22.78 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 258 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>