77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4206 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_4206  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 170 aa  355  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000156355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4345  transcriptional regulator, XRE family  43.32 
 
 		 218 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.759199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  37.21 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0909  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 115 aa  67  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  38.81 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  40.91 
 
 		 209 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0038  Helix-turn-helix domain protein  32.81 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000109438  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 242 aa  52.4  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 245 aa  52  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 483 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 461 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  27.78 
 
 		 461 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 491 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0763  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.305784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 464 aa  48.9  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 482 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 480 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 480 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 481 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  27.47 
 
 		 461 aa  47.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 483 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  43.14 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 480 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  27.07 
 
 		 484 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 464 aa  45.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  30 
 
 		 376 aa  45.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  36.67 
 
 		 366 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 189 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 474 aa  45.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 218 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 469 aa  45.1  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  33.78 
 
 		 219 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 133 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 133 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  35.21 
 
 		 259 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08220  DNA-binding protein RDGA  32.26 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  26.14 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0762  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  28.36 
 
 		 464 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  36.73 
 
 		 475 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 469 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2421  helix-turn-helix domain-containing protein  32.39 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195917  normal  0.223738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  41.18 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 470 aa  42.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  29.11 
 
 		 483 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  30.14 
 
 		 132 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 470 aa  42.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 466 aa  42  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  27.85 
 
 		 472 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 152 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  31.51 
 
 		 240 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 117 aa  41.6  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  33.33 
 
 		 245 aa  42  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 97 aa  41.6  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 252 aa  41.6  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  30.23 
 
 		 143 aa  41.6  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 78 aa  41.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  31.43 
 
 		 220 aa  41.6  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 495 aa  41.2  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  35.29 
 
 		 270 aa  41.2  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 73 aa  41.2  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  24.55 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 197 aa  40.8  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 128 aa  40.8  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 182 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 182 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  31.65 
 
 		 470 aa  40.8  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 77 aa  40.4  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  34.78 
 
 		 239 aa  40.8  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>