24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0909 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0909  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 115 aa  233  7e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0038  Helix-turn-helix domain protein  45.59 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000109438  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4206  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 170 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000156355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  39.74 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4345  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.759199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  27.38 
 
 		 216 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 245 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  25.24 
 
 		 209 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 212 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0970  Cro/CI family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0726306  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 491 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1708  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 231 aa  42  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0192115  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  32.31 
 
 		 270 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4920  putative phage repressor  25.58 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 321 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  28.95 
 
 		 503 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  23.76 
 
 		 209 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  22.86 
 
 		 216 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 477 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 189 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  25.86 
 
 		 488 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  27.63 
 
 		 238 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  24.07 
 
 		 152 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>