114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1689 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  100 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  35.83 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  38.57 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  31.22 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  30.8 
 
 		 264 aa  85.1  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  33.56 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  29.65 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  36.43 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  33.53 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  28.57 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  28.95 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  26.61 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  28.51 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  30.3 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  31.08 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  26.25 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  47.42 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  26.23 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  24.89 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  25.74 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  24.45 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  33.04 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  25.84 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4500  putative phage repressor  32.26 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  25.62 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  23.32 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  34.26 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  26.03 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  24.79 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  24.79 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  25.93 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  32.56 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  25.33 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3742  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 130 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  25.21 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  25.93 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  25.81 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  28.76 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  25.52 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  34.19 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  41.67 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  36.84 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  31.07 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  23.55 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  35.42 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  24.49 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  39.58 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  26.29 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  29.79 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  27.08 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  31.25 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  23.75 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  35.48 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  24.7 
 
 		 229 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  26.09 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  24.6 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  32.18 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  25.69 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  24.58 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  24.7 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1608  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  30.85 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  28.21 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  22.09 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  25.74 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  33.67 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 283 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  29.41 
 
 		 252 aa  48.5  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  29.52 
 
 		 225 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3795  hypothetical protein  32.61 
 
 		 190 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  31.71 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  31.71 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  24 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  29.41 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1395  putative phage repressor  31.11 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  30.85 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0762  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 132 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2421  helix-turn-helix domain-containing protein  40.91 
 
 		 132 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195917  normal  0.223738 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  35.05 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  25.31 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  28.57 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1166  phage-related repressor protein  29.75 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000408495  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  31.11 
 
 		 289 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 		 132 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1066  putative phage repressor  30 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000341462  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 272 aa  45.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  34.12 
 
 		 144 aa  45.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4531  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 174 aa  45.4  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  33.7 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1678  putative phage repressor  37.5 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  30.84 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 133 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  29.13 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3976  prophage MuMc02, S24 family peptidase  44.9 
 
 		 57 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.275269 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>