92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1326 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  28.64 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  29.23 
 
 		 235 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  32.58 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  32.13 
 
 		 247 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  30.15 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  30.92 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  30.96 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  32.99 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  30.61 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  37.78 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  28.5 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  31.16 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  30.64 
 
 		 238 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  32.37 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  32.17 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  29.26 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  34.76 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  31.43 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  25.13 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  32.88 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  33.56 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  29.58 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  25.98 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  31.58 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  24.29 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  28.87 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  29.93 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  27.81 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  31.29 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  30 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  29.94 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  28.57 
 
 		 251 aa  62  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  31.91 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  28.38 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  29.2 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  33.33 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  36.22 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  29.93 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  28.47 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  31.02 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  28.31 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  31.43 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  29.37 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  28.47 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  28.21 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  26.67 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  24.87 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  28.27 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  28.26 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  28.76 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  29.41 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  26.28 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  25.55 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  28.48 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  24.26 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  25.55 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  29.37 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  28.78 
 
 		 284 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  28.18 
 
 		 265 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  28.1 
 
 		 292 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  27.18 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  27.27 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  26.32 
 
 		 270 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  26.52 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  30.77 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  26.28 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  26.47 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  27.91 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  27.42 
 
 		 289 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  33.33 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  33.33 
 
 		 235 aa  48.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2911  putative phage repressor  29.03 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204879  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  28.08 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  22.11 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  31.21 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  26.72 
 
 		 273 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  28.06 
 
 		 259 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  31.28 
 
 		 263 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  23.74 
 
 		 284 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1166  phage-related repressor protein  24.28 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000408495  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  28.87 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  34.78 
 
 		 231 aa  42.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 283 aa  42  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  27.18 
 
 		 246 aa  41.6  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>