35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4500 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4500  putative phage repressor  100 
 
 		 234 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  43.04 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  33.33 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  32.26 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  34.34 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  43.55 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  31.13 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  30.43 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  30.43 
 
 		 270 aa  48.9  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  30.34 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  30.77 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  31.58 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  22.22 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  38.16 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1678  putative phage repressor  41.76 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  22.84 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2265  hypothetical protein  30.48 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.843023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  25 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  33.33 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  28.3 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  37.5 
 
 		 292 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  25.55 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  22.16 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  30.56 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  30.56 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  25.58 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  28.71 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  35.96 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  23.74 
 
 		 237 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  36.71 
 
 		 210 aa  42  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>