188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0726 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  100 
 
 		 225 aa  463  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  50.44 
 
 		 238 aa  221  6e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  52.29 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  46.57 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  36.28 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  39.72 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  37.57 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  31.38 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  31.38 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  49.25 
 
 		 261 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  33.33 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  31.38 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  32.03 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  32.64 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  32.03 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  31.6 
 
 		 233 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  33.33 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  32.44 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  31.44 
 
 		 263 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  31.56 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  28.51 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  28.15 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  32.72 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  38.13 
 
 		 270 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  38.85 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  31.02 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  27.19 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  29.57 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  26.27 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  24.19 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  29.26 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  31.19 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  28.63 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  28.51 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  27.35 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  25.58 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  25.82 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  29.09 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  25.82 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  28.45 
 
 		 256 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  26.48 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  27.59 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  27.18 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  24.52 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  22.69 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  28.73 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  29.32 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  28.02 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  22.86 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  29.94 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  27.98 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  31.11 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  23.32 
 
 		 231 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  25 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  30.5 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  33.12 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  26.83 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  22.84 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  25.97 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  25.32 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  25.81 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  25.93 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  31.1 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  22.27 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  28.63 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  25.74 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  30.91 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  28.18 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  23.04 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  26.46 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  25.4 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 110 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  24.68 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  45.16 
 
 		 131 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  23.62 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  28.57 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  23.79 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  30 
 
 		 235 aa  52  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  25.46 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  22.9 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  27.85 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  26.54 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  30.66 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  27.13 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  35.94 
 
 		 71 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  25.83 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  26.54 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  22.69 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>