94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4113 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  29.33 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  31.54 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  35.71 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  31.98 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  33.57 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  28.04 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  32.65 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  32.86 
 
 		 247 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  32.88 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  30.52 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  32.41 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  32.14 
 
 		 247 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  32.14 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  28.04 
 
 		 206 aa  62  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  31.91 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  32.46 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  31.62 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  36.88 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  29.37 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  34.65 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  31.82 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  29.41 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  29.41 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  33.97 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  33.83 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  33.83 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  27.33 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  34.65 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  30.16 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  27.42 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  31.4 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  34.19 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  26.71 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  28.85 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  29.53 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  35.71 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  27.86 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  25 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  26.95 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  26.71 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  36.94 
 
 		 256 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  37 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  26.73 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  26.95 
 
 		 270 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  28.5 
 
 		 270 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  30.12 
 
 		 243 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  31.53 
 
 		 238 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  27.78 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  26 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  27.13 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  33.88 
 
 		 248 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  29.93 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 272 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  30.09 
 
 		 144 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  29.73 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  31.21 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 283 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  32.85 
 
 		 241 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  31.13 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  26.44 
 
 		 289 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000855833  hitchhiker  0.0000527672 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  33.05 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  26.44 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  29.53 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  35.59 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  27.22 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0272  transcriptional regulator, putative  22.34 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  34.62 
 
 		 265 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  28.87 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  32.62 
 
 		 269 aa  45.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  30.69 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  27.32 
 
 		 231 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  23.98 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  28.37 
 
 		 289 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131906  hitchhiker  0.000000754842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  30.91 
 
 		 273 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  23.97 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  30.93 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  37.04 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1066  putative phage repressor  24.69 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000341462  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  26.76 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  27.38 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  26.01 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  37.04 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  24.51 
 
 		 206 aa  42  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  26.55 
 
 		 213 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  33.75 
 
 		 243 aa  42  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  27.68 
 
 		 222 aa  41.6  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>