17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4531 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4531  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  344  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  42.03 
 
 		 244 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  40.3 
 
 		 230 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  33.33 
 
 		 244 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  33.33 
 
 		 239 aa  45.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1531  XRE family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 189 aa  44.3  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000256618  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  29.47 
 
 		 259 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  35.48 
 
 		 131 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  47.06 
 
 		 367 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0958  helix-turn-helix domain-containing protein  33.87 
 
 		 132 aa  42.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3742  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 130 aa  42  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0294477  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  47.06 
 
 		 367 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1708  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 231 aa  41.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0192115  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  47.06 
 
 		 367 aa  41.6  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1608  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 185 aa  40.8  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>