16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1708 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1708  transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0192115  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2803  bacteriophage CI repressor  35.17 
 
 		 155 aa  92.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10438  transcriptional regulator, putative  49.25 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1063  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.150252 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1905  HTH_3 family transcriptional regulator protein  46.77 
 
 		 148 aa  71.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1044  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 125 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329411  normal  0.26776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2000  transcriptional regulator, XRE family  25.83 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221845  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0868  putative phage repressor  34.09 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000901562  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0038  Helix-turn-helix domain protein  43.75 
 
 		 120 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000109438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4185  hypothetical protein  35.38 
 
 		 122 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.373535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  38.33 
 
 		 143 aa  46.2  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2433  hypothetical protein  29.69 
 
 		 121 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0270  hypothetical protein  32.35 
 
 		 123 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 528 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  29.47 
 
 		 321 aa  42.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0909  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 115 aa  42  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>