173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2775 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  100 
 
 		 264 aa  541  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  98.86 
 
 		 264 aa  533  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  36.86 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  36.24 
 
 		 247 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  31.38 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  36.44 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  35 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  34.32 
 
 		 247 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  32.62 
 
 		 251 aa  105  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  32.9 
 
 		 230 aa  102  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  29.95 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  33.19 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  32.62 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  33.49 
 
 		 256 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  31.84 
 
 		 244 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  34.78 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  31.02 
 
 		 244 aa  96.3  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  33.02 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 245 aa  95.5  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 245 aa  95.5  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  40.85 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  27.48 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  28.05 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  30.29 
 
 		 211 aa  89  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  29.29 
 
 		 219 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  34.59 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  31.87 
 
 		 236 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  28.81 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  38.19 
 
 		 193 aa  87  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  33.04 
 
 		 225 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  31.12 
 
 		 302 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  39.6 
 
 		 222 aa  85.5  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  30.96 
 
 		 270 aa  85.1  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  30.8 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  35.17 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  28.38 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  31.16 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  35.17 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  30.29 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  27.23 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  26.74 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  28.57 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  28.15 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  28.15 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  29.96 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  28.76 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  34.56 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  25.97 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  37.23 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  29.96 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  24.79 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  29 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  29.52 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  30.61 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  30.83 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  25.91 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  26.36 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  32.14 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  27.4 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  37.31 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  27.71 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  27.8 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  28.57 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  29.13 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  31.06 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  28.27 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  29.63 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  27.71 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  25.96 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  28.15 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  25.96 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  35.04 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  31.58 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  29.14 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  32.43 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  26.61 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  30.97 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  26.69 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  30.08 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  23.6 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  23.6 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  25.94 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  23.05 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  25.64 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  26.58 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  30.36 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  29.41 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  23.83 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  25.52 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  24.8 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1976  transcriptional regulator, XRE family  27.03 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  24.15 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  26.5 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  25.42 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3391  putative prophage repressor  26.03 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711365  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  25.41 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  25 
 
 		 205 aa  55.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  39.73 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>