76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1158 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 270 aa  554  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  55.02 
 
 		 249 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  55.3 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  42.14 
 
 		 236 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  31.69 
 
 		 238 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  33.52 
 
 		 229 aa  88.6  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  35.71 
 
 		 211 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  38.13 
 
 		 225 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  31.16 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  31.16 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  34.36 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  38.24 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  33.55 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  33.57 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  36.57 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  31.97 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  29.32 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  31.21 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  32.62 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  32.62 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  28.37 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  28.37 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  31.76 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  24.9 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  33.78 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  33.8 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  38.14 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  32.17 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  31.51 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  34.21 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  26.54 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  25.63 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  31.62 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  35.97 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  37.14 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  31.25 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  26.48 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  31.69 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  31.03 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  24.71 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  26.42 
 
 		 256 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  28.06 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  31.25 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  31.25 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  25.91 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  33.33 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  26.79 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  24.69 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  34.07 
 
 		 225 aa  49.3  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  33.33 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  25.51 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  32.58 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  25.29 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  29.94 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  24.9 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  26.24 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  26.87 
 
 		 214 aa  46.2  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  30.65 
 
 		 234 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  24.9 
 
 		 229 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  25.98 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  27.38 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1395  putative phage repressor  33.33 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  33.33 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  23.64 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  25.1 
 
 		 263 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  30.23 
 
 		 219 aa  43.1  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  25.61 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  30.3 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2394  Cro/CI family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>