207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1965 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  100 
 
 		 263 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  75 
 
 		 243 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  61.63 
 
 		 272 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  56.22 
 
 		 229 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  55.79 
 
 		 229 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  56.9 
 
 		 233 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  56.22 
 
 		 229 aa  276  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  56.9 
 
 		 233 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  56.47 
 
 		 233 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  56.65 
 
 		 240 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  55.17 
 
 		 240 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  53.15 
 
 		 225 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  50.21 
 
 		 237 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  50.21 
 
 		 237 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  53.02 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  46.88 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  45.98 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  41.11 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  44.17 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  40.18 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  39.52 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  39.52 
 
 		 244 aa  161  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  36.99 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  35.9 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  33.89 
 
 		 243 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  54.61 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  36.75 
 
 		 209 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  35.34 
 
 		 205 aa  122  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  30.8 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  30.77 
 
 		 214 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  35.37 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  31.36 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  31.44 
 
 		 225 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  28.33 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  27.48 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  52.7 
 
 		 135 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  52.7 
 
 		 135 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  29.91 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  27.75 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0582  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794333 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  27.43 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  40.7 
 
 		 216 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  28.86 
 
 		 215 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  40.7 
 
 		 216 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  35.16 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  27.27 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  32.89 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0537  transcriptional regulator, putative  26.5 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  48.44 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  27.71 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  32.89 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  25.74 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  25.75 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  46.97 
 
 		 135 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  47.76 
 
 		 131 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  28.46 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  27.12 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0576  hypothetical protein  25.32 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664353  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  46.97 
 
 		 135 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  33 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  25.81 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  32.47 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  30.05 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  34.71 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  27.71 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  34.71 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  26.91 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  27.17 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  25 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  25.63 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  25.46 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  42.86 
 
 		 71 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  31.75 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  31.75 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08220  DNA-binding protein RDGA  25 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  25.93 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  25.96 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  27.19 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  36.26 
 
 		 421 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  36.26 
 
 		 421 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  22.91 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 128 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  26.48 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  29.37 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  26.11 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1531  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 189 aa  53.1  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000256618  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  35 
 
 		 141 aa  52.4  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  24.09 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  23.36 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  40.32 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0707  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 104 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  28.3 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  38.89 
 
 		 144 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 204 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 115 aa  48.9  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>