140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1261 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  100 
 
 		 236 aa  477  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  55.27 
 
 		 238 aa  255  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  53.39 
 
 		 229 aa  252  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  52.29 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  43.67 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  40.17 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  36.92 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  38.6 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  36.56 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  42.14 
 
 		 270 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  32.64 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  33.47 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  28.82 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  31.32 
 
 		 264 aa  89.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  31.87 
 
 		 264 aa  88.6  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  37.34 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  30.51 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  30.92 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  28.23 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2949  DNA-binding protein, putative  28.51 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  28.27 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  28.45 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  26.55 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0868  putative phage repressor  28.33 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0373508  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  29.65 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  29.46 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  26.55 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  33.1 
 
 		 193 aa  67  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  34.97 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  34.97 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  32.35 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1230  hypothetical protein  34.55 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.384901  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  37.5 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  29.05 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  27.62 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  28.51 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  26.67 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  26.67 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  29.05 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  26.19 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  29.85 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  31.25 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3391  putative prophage repressor  28.26 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711365  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  36.03 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  30.28 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1712  CI repressor  22.92 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0120781  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  27.67 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  27.39 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  21.52 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  30.14 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  28.63 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2707  putative PAS/PAC sensor protein  47.46 
 
 		 640 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109569 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  34.33 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  30.83 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  23.14 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  27.31 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  28.57 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  26.29 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  24.38 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  25.33 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1586  putative PAS/PAC sensor protein  45.76 
 
 		 541 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.822014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  27.74 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  26.64 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  22.64 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  26.11 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3355  hypothetical protein  34.92 
 
 		 90 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.791337  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  32.14 
 
 		 147 aa  53.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  27.94 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  25.88 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  20.85 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  28.11 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  25.44 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1994  putative PAS/PAC sensor protein  38.46 
 
 		 543 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199074  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  26.41 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  28.57 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  24.47 
 
 		 284 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  25 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  25.82 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  26.09 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  33.83 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  27.01 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1321  hypothetical protein  20.99 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  24.11 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  31.01 
 
 		 289 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  29.73 
 
 		 216 aa  49.3  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  31.06 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3705  CI repressor  34.38 
 
 		 126 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  36.73 
 
 		 289 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  30.5 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  28.95 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  30.3 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  26.89 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  34.04 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2423  LexA repressor  35.79 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>