63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_1013 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  100 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  94.58 
 
 		 211 aa  397  9.999999999999999e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0508  DNA-binding protein  37.75 
 
 		 194 aa  125  5e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0116829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  30.69 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  27.31 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0925  hypothetical protein  42.62 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  31.21 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  39.18 
 
 		 292 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  22.27 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  31.91 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  27.09 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  23.35 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  22.91 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  32.58 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  33 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  31.96 
 
 		 247 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  31.96 
 
 		 247 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  27.01 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  29.13 
 
 		 289 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  21.92 
 
 		 263 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  29.73 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  21.92 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  22.27 
 
 		 241 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  34.09 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  38.04 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  24.74 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  33.71 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  25.48 
 
 		 251 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  21.7 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  21.7 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5157  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 107 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086798  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  30.28 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  24.31 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  23.11 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  34.04 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  25.79 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  23.3 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 248 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  22.71 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  34.04 
 
 		 269 aa  46.2  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  33.7 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  30.1 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  24.71 
 
 		 259 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  29 
 
 		 229 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  32.98 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  26.54 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  33.33 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  26.45 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  32.94 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2384  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 82 aa  42.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0803  hypothetical protein  30.43 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0115457  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  27.08 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 107 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  23.88 
 
 		 231 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 91 aa  42  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 252 aa  42  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  30.11 
 
 		 216 aa  42  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  30 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 107 aa  41.6  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>