59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0717 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  100 
 
 		 239 aa  486  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  27.56 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  27.11 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  27.54 
 
 		 212 aa  72  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  30.54 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  26.25 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  32.62 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  25.83 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  26.46 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  26.55 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  27.23 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  27.8 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  25.51 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  26.55 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  26.37 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  25.43 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  27.31 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  25.82 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  27.07 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  27.5 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  24.17 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  36.36 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1669  helix-turn-helix domain protein  35.8 
 
 		 163 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  26.64 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2378  bacteriophage CI repressor  45.16 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00068987  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  29.37 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  26.57 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  23.41 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  26.81 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  23.98 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  25.76 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  23.66 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1503  LexA repressor  23.01 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.106376 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  30.07 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  25.76 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  24.11 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  24.06 
 
 		 270 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  25.87 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  24.06 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  26.25 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  23.14 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  23.14 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  26.79 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.42 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1039  putative phage repressor  36.99 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  28.68 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  24.35 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  29.03 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0230  transcriptional regulator, XRE family  28.47 
 
 		 137 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737224  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.76 
 
 		 72 aa  42.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  28.87 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1189  hypothetical protein  26.88 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  23.31 
 
 		 270 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2994  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 109 aa  42  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>