118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1339 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  100 
 
 		 219 aa  454  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  32.29 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  32.16 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  32.16 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  31.71 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  30.8 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  30.04 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  31.28 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  32.3 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  33.96 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  34.09 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  28.44 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  29.95 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  27.23 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  28.32 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  30.32 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  28.65 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  26.87 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  29.67 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  30.46 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  27.88 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  26.73 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  25.11 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  26.64 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  27.96 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  26.92 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  27.12 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  26.03 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  26.03 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  27.93 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  27.57 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  29.41 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  22.53 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2184  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 289 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233914  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  26.53 
 
 		 234 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  27.7 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  25.17 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  35.62 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0958  helix-turn-helix domain-containing protein  39.71 
 
 		 132 aa  50.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  26.75 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  28.89 
 
 		 144 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  42.03 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  46.03 
 
 		 273 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  31.13 
 
 		 139 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  32.2 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  31.13 
 
 		 139 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  31.13 
 
 		 139 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  31.13 
 
 		 139 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  27.38 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  25.93 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  25.93 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  25.93 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  29.63 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  24.37 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  38.2 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  44.62 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  43.42 
 
 		 518 aa  47  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  23.92 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1223  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.04 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.995499 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 142 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  27.4 
 
 		 139 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1468  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  40.28 
 
 		 534 aa  45.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  27.01 
 
 		 251 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  26.71 
 
 		 139 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  26.71 
 
 		 139 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  26.71 
 
 		 139 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  26.71 
 
 		 139 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  26.71 
 
 		 139 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  26.71 
 
 		 139 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  26.71 
 
 		 139 aa  45.4  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  26.71 
 
 		 139 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  37.04 
 
 		 301 aa  45.1  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0191  hypothetical protein  23.26 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  23.27 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 133 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 374 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2265  XRE family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000780415  unclonable  0.00000217866 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  30.26 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  30.26 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  35.48 
 
 		 505 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  26.54 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  26.54 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  27.64 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  35.71 
 
 		 374 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  28 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 368 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>