39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1223 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1223  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 197 aa  406  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.995499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  34.69 
 
 		 127 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 123 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 142 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  37.31 
 
 		 301 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 133 aa  46.2  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  34 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  32.04 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 72 aa  45.8  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 104 aa  45.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 115 aa  43.9  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 115 aa  43.9  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  40.43 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2182  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293373  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2302  XRE family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018449  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 321 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.29 
 
 		 72 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 		 69 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 114 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0468  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 82 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000157698  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  34 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3019  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 281 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 72 aa  42.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  40 
 
 		 73 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 104 aa  42.4  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 73 aa  42  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  34 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 82 aa  42  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  40 
 
 		 73 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  40 
 
 		 73 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 65 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 99 aa  41.6  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  40 
 
 		 73 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  40 
 
 		 73 aa  41.6  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  29.63 
 
 		 342 aa  41.2  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 78 aa  41.2  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>