More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0437 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  68.92 
 
 		 505 aa  744    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1468  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  65.92 
 
 		 534 aa  725    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  100 
 
 		 518 aa  1081    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  64.2 
 
 		 508 aa  697    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0167  aminotransferase AlaT  68.24 
 
 		 404 aa  586  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  65.84 
 
 		 404 aa  575  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  62.59 
 
 		 403 aa  549  1e-155  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  60.85 
 
 		 409 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  60.9 
 
 		 404 aa  534  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0619  aminotransferase AlaT  59.31 
 
 		 404 aa  533  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  59.31 
 
 		 406 aa  528  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  58.9 
 
 		 405 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  58.9 
 
 		 405 aa  525  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  58.9 
 
 		 405 aa  525  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  58.9 
 
 		 405 aa  525  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  59.9 
 
 		 405 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  59.15 
 
 		 404 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  59.15 
 
 		 404 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  58.9 
 
 		 405 aa  525  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  60.75 
 
 		 426 aa  527  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  58.9 
 
 		 405 aa  525  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  58.9 
 
 		 405 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  58.9 
 
 		 405 aa  525  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  59.15 
 
 		 404 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  59.15 
 
 		 404 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  59.06 
 
 		 404 aa  525  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  59.4 
 
 		 404 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  59.4 
 
 		 404 aa  524  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  59.4 
 
 		 404 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  59.4 
 
 		 404 aa  525  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  58.56 
 
 		 404 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  59.15 
 
 		 404 aa  523  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  58.56 
 
 		 404 aa  522  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  58.9 
 
 		 405 aa  523  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1872  aminotransferase AlaT  61.35 
 
 		 403 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.866522  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1481  aminotransferase AlaT  61.35 
 
 		 403 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  58.4 
 
 		 404 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  58.15 
 
 		 404 aa  519  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1164  aminotransferase AlaT  56.87 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3843  aminotransferase AlaT  61.35 
 
 		 403 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0237926  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  58.56 
 
 		 404 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  60.9 
 
 		 403 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1447  aminotransferase AlaT  61.35 
 
 		 403 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0541953  normal  0.418968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  58.15 
 
 		 418 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  57.82 
 
 		 404 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2327  aminotransferase AlaT  60.65 
 
 		 403 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  57.82 
 
 		 404 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  57.82 
 
 		 404 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  57.82 
 
 		 404 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  58.56 
 
 		 404 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  58.06 
 
 		 404 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  57.32 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1348  aminotransferase AlaT  57.83 
 
 		 410 aa  514  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.613177  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  55.71 
 
 		 429 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  60.65 
 
 		 403 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2034  aminotransferase AlaT  56.68 
 
 		 409 aa  513  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  57.82 
 
 		 404 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  57.82 
 
 		 404 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  56.75 
 
 		 406 aa  510  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  58.69 
 
 		 409 aa  511  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27500  aminotransferase AlaT  59.65 
 
 		 403 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223  normal  0.0677346 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  57 
 
 		 406 aa  508  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  57.32 
 
 		 413 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  56.47 
 
 		 404 aa  510  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1779  aminotransferase, classes I and II  59.35 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  57.36 
 
 		 409 aa  506  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3615  aminotransferase AlaT  59.35 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  58.19 
 
 		 427 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3983  aminotransferase AlaT  60.1 
 
 		 403 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0903  aminotransferase AlaT  60.2 
 
 		 429 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1047  aminotransferase AlaT  60.2 
 
 		 429 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  56.08 
 
 		 404 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  57.57 
 
 		 404 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  58.06 
 
 		 403 aa  504  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  57.68 
 
 		 414 aa  503  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  57.32 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  55.58 
 
 		 404 aa  501  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  57.57 
 
 		 404 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  54.55 
 
 		 422 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2048  aminotransferase AlaT  55.58 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000163504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  53.77 
 
 		 404 aa  495  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  55.77 
 
 		 426 aa  498  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  55.86 
 
 		 409 aa  495  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2197  aminotransferase AlaT  56.86 
 
 		 412 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141545  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3601  aminotransferase AlaT  55.44 
 
 		 405 aa  492  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  55 
 
 		 404 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  48.17 
 
 		 543 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  56.17 
 
 		 407 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  56.42 
 
 		 403 aa  491  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1552  aminotransferase AlaT  57.93 
 
 		 409 aa  491  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1765  aminotransferase AlaT  57.86 
 
 		 412 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.436136  normal  0.213535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2579  aminotransferase AlaT  56.11 
 
 		 435 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  46.5 
 
 		 546 aa  487  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10342  aminotransferase AlaT  53.94 
 
 		 429 aa  488  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  54.77 
 
 		 404 aa  488  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0618  aminotransferase AlaT  53.07 
 
 		 426 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647931  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3207  aminotransferase AlaT  53.88 
 
 		 410 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  55.72 
 
 		 404 aa  485  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6224  aminotransferase AlaT  58.1 
 
 		 412 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  54.41 
 
 		 409 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>