139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3550 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  100 
 
 		 235 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  34.23 
 
 		 220 aa  121  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  36.45 
 
 		 216 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  34.25 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  32.52 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  32.52 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  33.82 
 
 		 218 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  31.07 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  32.43 
 
 		 218 aa  95.5  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  30.14 
 
 		 236 aa  94.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  33.99 
 
 		 217 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  29.44 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  28.95 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 209 aa  85.5  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  29.47 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  28.57 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  30.53 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  30.45 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  29.55 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  29.55 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  27.7 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  30.28 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  31.14 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  41.54 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  32.2 
 
 		 243 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  27.23 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  41.18 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  27.66 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  33.09 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  29.23 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  24.89 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0176  hypothetical protein  27.32 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  32.54 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  27.49 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  28.7 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  34.12 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  34.29 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  30.21 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0191  hypothetical protein  23.96 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  28.36 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  28.18 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  27.01 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  36.03 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  29.57 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  30.46 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  27.31 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  26.16 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  37.08 
 
 		 120 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  26.16 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  27.96 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  23.14 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  23.14 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  28.89 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  26.86 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  28.03 
 
 		 149 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  27.75 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  26.03 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  25.97 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  40.48 
 
 		 126 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  25.17 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  23.03 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.97 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 245 aa  48.5  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  32.26 
 
 		 71 aa  48.5  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4890  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 157 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2265  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 145 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000780415  unclonable  0.00000217866 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  26.07 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  24.4 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  28.42 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  26.32 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  26.32 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  38.04 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1234  putative prophage repressor  27.64 
 
 		 153 aa  46.2  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000530915  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1954  Phage repressor protein  25.43 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  21.63 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  24.8 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  26.32 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  24.23 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  25.83 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3151  Repressor lexA  31.87 
 
 		 154 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.662921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  23 
 
 		 256 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  26.87 
 
 		 209 aa  45.1  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  33.33 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  26.7 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  22.6 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.66 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>