49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0989 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  100 
 
 		 239 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  36.29 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  30.51 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  30.51 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  35.56 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  35.04 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  30.95 
 
 		 215 aa  72  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  37.3 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  37.3 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  38.35 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  28.63 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  34.31 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  34.31 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  30.56 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 240 aa  62  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  30 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  33.79 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  27.93 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  29.33 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  29.1 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.89 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  27.12 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  32.85 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  32.74 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  34.35 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  32.59 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  31.08 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  27.16 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  27.63 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  31.09 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  30.99 
 
 		 133 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  30.4 
 
 		 230 aa  48.9  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  30.88 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  31.78 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1794  peptidase S24 and S26 domain protein  30.15 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.854647  decreased coverage  0.00408927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  24.42 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  30.77 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  34.83 
 
 		 331 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  33.04 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  39.71 
 
 		 120 aa  43.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  30.1 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>