61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0580 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  100 
 
 		 238 aa  492  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  99.54 
 
 		 216 aa  443  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0176  hypothetical protein  32.78 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.95 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  27.04 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  31.3 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  31.3 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  26.58 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  25.91 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  37.3 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  31.01 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  30.23 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  30.23 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0191  hypothetical protein  28.49 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  24.62 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  28.68 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  30.28 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  33.66 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  25.58 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  25.82 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  24.54 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  26.19 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  24.14 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  24.09 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  23.45 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  25.56 
 
 		 133 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  23.19 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  22.71 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  23.39 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  25 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  28.32 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0023  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 108 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.181624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  26.9 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  23.48 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  26.51 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  26.51 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  26.51 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  27.59 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  24.89 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  24.89 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  30.49 
 
 		 371 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  22.12 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  29.1 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  31.82 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  26.87 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  21.48 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  43.66 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  23.76 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  23.96 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  32.94 
 
 		 126 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  22.55 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>