164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1815 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  36.18 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  35.61 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  36.18 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  38.31 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  30.66 
 
 		 221 aa  98.2  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 240 aa  95.9  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  35.32 
 
 		 240 aa  95.9  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  35.32 
 
 		 240 aa  95.9  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  36.08 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  29.33 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  31.73 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  30.66 
 
 		 237 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 229 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  33.33 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  31.02 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  38.64 
 
 		 243 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  33.79 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  33.33 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  38.17 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  31 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  30.3 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  37.39 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  31.66 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  30.77 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  39.52 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  29.8 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 240 aa  74.7  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  40.16 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  41.18 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  28.86 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  29.17 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  26.19 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  30.56 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  36.96 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 235 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  29.58 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  30.85 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  27.96 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  24.71 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  26.39 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  26.39 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  26.39 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  32.31 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  24.14 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  26.96 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  29.69 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  30.37 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.17 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  27.13 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2454  LexA repressor  28.12 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212024  normal  0.397716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  30 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  29.35 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  28.88 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  28.89 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  29.69 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3151  Repressor lexA  34.58 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.662921  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  25.89 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  25.53 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.3 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0891  peptidase S24 and S26 domain protein  31.75 
 
 		 338 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.352562  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0191  hypothetical protein  23.23 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  31.53 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  27.69 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  31.53 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  27.69 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  28.46 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  37.08 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0696  putative prophage repressor  35.14 
 
 		 157 aa  48.9  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00336277  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  24.61 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  26.7 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4056  LexA family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  27.34 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  26.29 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.22 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  26.52 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  29.27 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  25.65 
 
 		 269 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  29.27 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  25.65 
 
 		 269 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  29.27 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  25.65 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  29.27 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  25.95 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  25.65 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  35.71 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  25.65 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  29.37 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  37.23 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3718  LexA repressor  38.37 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.875348  normal  0.435562 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  37.23 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>