119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1456 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  100 
 
 		 240 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  100 
 
 		 240 aa  488  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  47.68 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  47.7 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  50.23 
 
 		 216 aa  201  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  50.23 
 
 		 216 aa  201  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  46.64 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  44.1 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  43.12 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  41.45 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 229 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  40.35 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  43 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  41.82 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  43.14 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  43.84 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  41.78 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  37.73 
 
 		 231 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  52.85 
 
 		 133 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 228 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  35.84 
 
 		 216 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  34.08 
 
 		 221 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  32.03 
 
 		 232 aa  111  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  42.14 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  34.2 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  37.28 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  29.31 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  35.32 
 
 		 207 aa  95.9  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  33.85 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  39.39 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 234 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  31.84 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  27.91 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  38.85 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  29.03 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  29.55 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  30.51 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  31.3 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  31.3 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  40.21 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  26.03 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  33.33 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  29.82 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  24.32 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  40.74 
 
 		 421 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  39.29 
 
 		 126 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1563  repressor protein CI homolog  37.5 
 
 		 164 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116798  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03030  SOS response transcriptional repressor, RecA-mediated autopeptidase  24.87 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000274718  hitchhiker  1.62281e-36 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  30.56 
 
 		 150 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  30.37 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  40.26 
 
 		 153 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  34.21 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  34.55 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  30.41 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0572  repressor LexA  35.38 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0263209 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  32.26 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.04 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  32.26 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2167  LexA repressor  29.82 
 
 		 202 aa  48.5  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  28.99 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  37.93 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.88 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  28.9 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  31.82 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0020  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.89 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000309012  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  37.08 
 
 		 143 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  30.95 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  30.25 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0755  SOS-response transcriptional repressor  38.38 
 
 		 128 aa  47.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  28.57 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  28.92 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.38 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  28.84 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.96 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3718  LexA repressor  34.15 
 
 		 199 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.875348  normal  0.435562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  34.43 
 
 		 239 aa  45.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  32.41 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  29.84 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.3 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  25.83 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  26.52 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  32.79 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  34.23 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0891  peptidase S24 and S26 domain protein  35.29 
 
 		 338 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.352562  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  32.79 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2045  LexA repressor  27.65 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613355  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  34.74 
 
 		 120 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  31.39 
 
 		 145 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  30.16 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>