34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03030 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_03030  SOS response transcriptional repressor, RecA-mediated autopeptidase  100 
 
 		 228 aa  475  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000274718  hitchhiker  1.62281e-36 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  29.38 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  25.63 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  24.88 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  24.88 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  24.87 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  24.87 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  26 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  31.46 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  20.53 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0593  transcriptional regulator, XRE family  27.21 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1503  LexA repressor  24 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.106376 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  27.23 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  25.75 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 196 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  24.54 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  28.68 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  48.72 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  23 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  25.91 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  27 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 380 aa  42.4  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  20.53 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  25.29 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  21.98 
 
 		 221 aa  42  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  29.51 
 
 		 200 aa  42  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 85 aa  42  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>