55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0593 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0593  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1503  LexA repressor  44.72 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.106376 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0782  XRE family transcriptional regulator  56.16 
 
 
108 aa  77  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2994  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1124  AAA ATPase  27.03 
 
 
793 aa  55.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.604428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1358  hypothetical protein  27.7 
 
 
800 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.908029  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  30.22 
 
 
210 aa  53.1  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1077  hypothetical protein  27.04 
 
 
796 aa  52.4  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  27.97 
 
 
222 aa  52.4  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  26.86 
 
 
207 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  28.65 
 
 
201 aa  52  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  31.79 
 
 
206 aa  51.6  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0572  repressor LexA  37.86 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0263209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  24.68 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  29.33 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1470  LexA repressor  31.97 
 
 
249 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000034906 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 
207 aa  48.5  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  24.45 
 
 
237 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  29.75 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03030  SOS response transcriptional repressor, RecA-mediated autopeptidase  27.21 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000274718  hitchhiker  1.62281e-36 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1468  LexA repressor  33.33 
 
 
288 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.097089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  24.11 
 
 
230 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  22.83 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  23.7 
 
 
229 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  30.77 
 
 
228 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  20.92 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  23.89 
 
 
239 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  30.16 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  27.67 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  25.42 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  31.11 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  26.2 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  27.81 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.28 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  27.15 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  27.15 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  27.15 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  27.15 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  30.77 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  27.15 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  27.15 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5333  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.86 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  28 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2198  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.78 
 
 
201 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.446469 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  26.24 
 
 
281 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  27.38 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  26.35 
 
 
269 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23040  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.03 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.620289  normal  0.0692962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  26.35 
 
 
269 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  27.15 
 
 
206 aa  42.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  26.11 
 
 
201 aa  42  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  26.6 
 
 
201 aa  41.6  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.75 
 
 
197 aa  42  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  26.37 
 
 
204 aa  41.6  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  26.26 
 
 
201 aa  41.6  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>