137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2810 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  32.52 
 
 		 216 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  32.52 
 
 		 216 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  31.25 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  33 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  29.15 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  29 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.36 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  26.07 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  26.13 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  26.07 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  25.69 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  28.24 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  27.6 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  27.15 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  28.84 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  26.01 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  29.82 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  29.82 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  29.41 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  27.44 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  23.45 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08220  DNA-binding protein RDGA  32.98 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  26.82 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  25.68 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  42.86 
 
 		 135 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 256 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  34.72 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  44.78 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  27.13 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  42.62 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  44.78 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  44.78 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  41.67 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  29.63 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  41.67 
 
 		 240 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 300 aa  52.4  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  32.61 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  49.12 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 115 aa  49.3  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 145 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 115 aa  49.3  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 115 aa  49.3  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  40 
 
 		 346 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 151 aa  48.5  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 142 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  40.32 
 
 		 131 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  23.88 
 
 		 245 aa  48.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  26.98 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  35.37 
 
 		 117 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 77 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1163  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 129 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 114 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 113 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  40.32 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  38.1 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  38.98 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  38.98 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0826  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 446 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 137 aa  46.2  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  29.84 
 
 		 176 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  26.29 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  38.1 
 
 		 301 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 67 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1025  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 130 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00102853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 152 aa  45.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 234 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 		 165 aa  45.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 152 aa  45.1  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 182 aa  45.1  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 118 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4206  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000156355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 432 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  45.76 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 117 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0763  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 130 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.305784 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000298649 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  25.53 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  37.84 
 
 		 543 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  22.93 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>