160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4635 on replicon NC_009999
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  100 
 
 		 214 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  38.97 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  37.38 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  34.04 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  33.76 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  32.91 
 
 		 240 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  33.62 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  33.19 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  34.33 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  32.89 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  33.18 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  32.44 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  30.77 
 
 		 263 aa  98.6  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  30.14 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  30.08 
 
 		 243 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  28.02 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  29.58 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0805  conserved hypothetical protein, putative peptidase S24  32.08 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  27.73 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  28.88 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  28.1 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  29.05 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  27.43 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  27.43 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  26.92 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  22.69 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  29.12 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  28.17 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  29.47 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  27.27 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  35.34 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  32.35 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  30.1 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  27.62 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  27.22 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  30.1 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  25.7 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  26.69 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  25.62 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  26.58 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  34.78 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  26.69 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  25.23 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  26.98 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  25.21 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  27.84 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  28.33 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  42.86 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  28 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  29.59 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  32.41 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  24.43 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  24.29 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  23.33 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  42.86 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  25.13 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  24.11 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  24.11 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  23.55 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  23.32 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  27.14 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  27.72 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  24.51 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1248  helix-turn-helix domain protein  32.39 
 
 		 109 aa  52.4  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000139831  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1712  CI repressor  26.04 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0120781  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  32.61 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 135 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  34.92 
 
 		 135 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  27.62 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  27.91 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  24.89 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  27.84 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08220  DNA-binding protein RDGA  25.27 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  31.47 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  27.63 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1025  helix-turn-helix domain-containing protein  39.06 
 
 		 130 aa  48.9  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00102853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  27.39 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  25.69 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  28.93 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  24.17 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  23.98 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  33.33 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  28.14 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1531  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000256618  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 73 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  26.51 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  43.64 
 
 		 64 aa  46.6  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  29.55 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>