27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1712 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1712  CI repressor  100 
 
 		 212 aa  420  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0120781  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  31.69 
 
 		 219 aa  104  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  34.69 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  30.4 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  30.05 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  30.05 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  24.87 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  26.11 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  24.75 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  22.92 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2949  DNA-binding protein, putative  24.26 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3355  hypothetical protein  43.64 
 
 		 90 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.791337  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0868  putative phage repressor  27.73 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0373508  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  29.09 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  26.04 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1287  CI repressor  26.17 
 
 		 128 aa  51.6  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  25.62 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  41.79 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  38.67 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  22.87 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0420  CI repressor  33.9 
 
 		 116 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  21.7 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  22.22 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  20.99 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  26.67 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  26.11 
 
 		 264 aa  41.6  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>