245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1413 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  100 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  49.62 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  49.06 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  44.19 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  42.38 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  38.6 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  37.84 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  34.19 
 
 		 238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  37.56 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1712  CI repressor  34.69 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0120781  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  31.02 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  33.5 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  30.09 
 
 		 235 aa  92  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  34.31 
 
 		 247 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  27.27 
 
 		 247 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  26.15 
 
 		 264 aa  78.2  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  36.57 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  30.96 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  32.54 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  30.83 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  27.7 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  29.35 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  28.57 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  27.56 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  38.81 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  34.07 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  29.65 
 
 		 219 aa  72  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2949  DNA-binding protein, putative  26.05 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  25.62 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  28.21 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  30.33 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  28.44 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  29.17 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  28.97 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  25.52 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  26.56 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  28.5 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  33.57 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  33.63 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  34.38 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  29.38 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  32.62 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  25 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  27.14 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  26.98 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  26.32 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0420  CI repressor  41.54 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3355  hypothetical protein  36.71 
 
 		 90 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.791337  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  25.36 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  25.71 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  28.71 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0868  putative phage repressor  23.25 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0373508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  28.39 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  26.19 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4920  putative phage repressor  28.64 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  23.21 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  30.71 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  23.12 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  27.17 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  27.12 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  28.71 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  25.51 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  25.51 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  25 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  24.66 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  23.98 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  23.98 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  25.7 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  25 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  29.22 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  27.1 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  25 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  22.27 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  26.09 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  25.64 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  33.81 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  33.81 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  32.82 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0805  conserved hypothetical protein, putative peptidase S24  25 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.74 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  32.53 
 
 		 144 aa  52.4  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  30.6 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.07 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  30.71 
 
 		 289 aa  52  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  39.02 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  29.5 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  29.93 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  29.93 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  27.27 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  31.71 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  36.14 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  22.83 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  28.3 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>