27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4920 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4920  putative phage repressor  100 
 
 		 255 aa  525  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13403  hypothetical protein  50.41 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  34.3 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  29.37 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0655  putative phage repressor  40.67 
 
 		 277 aa  98.6  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.119193  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2342  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 279 aa  95.5  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000474992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  29.3 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2028  transcriptional regulator, XRE family  29.78 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1968  XRE family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749676  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  22.92 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0272  transcriptional regulator, putative  25 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  25.89 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5487  hypothetical protein  23.55 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  27.37 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0038  Helix-turn-helix domain protein  27.96 
 
 		 120 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000109438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  24.27 
 
 		 216 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0868  putative phage repressor  23.26 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000901562  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 215 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  23.86 
 
 		 206 aa  46.2  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  28.5 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3355  hypothetical protein  36.71 
 
 		 90 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.791337  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  25.45 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  29.11 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  36.36 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0909  transcriptional regulator, XRE family  25.58 
 
 		 115 aa  42.4  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>