248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0352 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  100 
 
 		 261 aa  526  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  49.22 
 
 		 219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  49.23 
 
 		 216 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  41.15 
 
 		 211 aa  198  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  36.22 
 
 		 209 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  37.31 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  36.96 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  36.99 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  49.25 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1712  CI repressor  30.4 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0120781  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  35.93 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  26.86 
 
 		 264 aa  88.6  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  34.59 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  41.41 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  37.21 
 
 		 230 aa  86.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  38.76 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  38.97 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  38.57 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  37.76 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  36.21 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  33.54 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  35.88 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  26.64 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  26.23 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  29.05 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  28.74 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  28.03 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2949  DNA-binding protein, putative  27.51 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  28.52 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  35.1 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  34.78 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  29.17 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  28.47 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  35.92 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  35.51 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  35.51 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  35.61 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  27.5 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  42.15 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  32.56 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  25.83 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0868  putative phage repressor  25.76 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0373508  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  26.47 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  36.69 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  30.94 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  39.34 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  31.29 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  27.57 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  26.86 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  26.86 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  26.86 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  32.11 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  33.71 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  22.73 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  24.59 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0420  CI repressor  40.54 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  24.23 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  34.04 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  25 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  34.51 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  23.73 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  37.1 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  27.5 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  28.06 
 
 		 205 aa  57  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  24.58 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  32.24 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  35.71 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  31.75 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3355  hypothetical protein  41.67 
 
 		 90 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.791337  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  30.23 
 
 		 205 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  32.18 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  29.82 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  23.43 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  37.18 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  31.82 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  31.75 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  25.21 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  26.14 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  22.13 
 
 		 204 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  26.51 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  23.75 
 
 		 229 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  30.08 
 
 		 243 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  25.32 
 
 		 284 aa  52  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4738  LexA repressor  42.05 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483588  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  32.95 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1516  LexA repressor  42.05 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1496  LexA repressor  42.05 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  24.79 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  30.85 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1395  putative phage repressor  34.48 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  30 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0805  conserved hypothetical protein, putative peptidase S24  32.1 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>