92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00940 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  491  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  23.53 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13403  hypothetical protein  22.22 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0655  putative phage repressor  27.95 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.119193  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  25 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  28.06 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  29.57 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4920  putative phage repressor  22.92 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  26.77 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  29.41 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  26.13 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 135 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  24.76 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  21.98 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  25.89 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  22.9 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  24.79 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  22.73 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  23.5 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  27.46 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  22.73 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  24.85 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1968  XRE family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749676  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  33.78 
 
 		 328 aa  50.1  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  26.15 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  31.34 
 
 		 85 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  26.15 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2342  transcriptional regulator, XRE family  20.36 
 
 		 279 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000474992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 364 aa  49.7  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2028  transcriptional regulator, XRE family  25.12 
 
 		 273 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  48.9  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 334 aa  48.9  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1997  helix-turn-helix domain protein  31.88 
 
 		 107 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285438  hitchhiker  0.000964376 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  30.49 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 327 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0987  XRE family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.000000124238  decreased coverage  8.983340000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  23.93 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1571  helix-turn-helix domain protein  37.04 
 
 		 109 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140228  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  27.08 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  24.55 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  31.87 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 141 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  25 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5909  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 149 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 463 aa  46.2  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  24.88 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  25.97 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  30.68 
 
 		 118 aa  45.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  30.21 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 134 aa  45.8  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 139 aa  45.4  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 131 aa  45.4  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 144 aa  45.4  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  34.48 
 
 		 230 aa  45.4  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  28.8 
 
 		 225 aa  45.4  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  27.4 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0914  helix-turn-helix domain protein  30.88 
 
 		 106 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0680459  hitchhiker  0.00000175026 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  30.21 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 104 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2911  putative phage repressor  38.37 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204879  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1626  helix-turn-helix domain protein  38.71 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.365666 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  26.61 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  30.88 
 
 		 142 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 71 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  26.67 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3466  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 121 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3121  helix-turn-helix domain protein  34.92 
 
 		 105 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 129 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  34.21 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 128 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1818  helix-turn-helix domain protein  26.09 
 
 		 104 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0350108  decreased coverage  0.0000000000623016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  31.46 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  26.15 
 
 		 216 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  26.67 
 
 		 193 aa  42.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 152 aa  42.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  33.75 
 
 		 205 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  30.14 
 
 		 163 aa  42.4  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  23.96 
 
 		 468 aa  42.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 475 aa  42.4  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3040  putative phage repressor  28.85 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 488 aa  42.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  29.55 
 
 		 247 aa  42  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 359 aa  41.6  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  23.85 
 
 		 270 aa  41.6  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 137 aa  42  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>