25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13403 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13403  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  523  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4920  putative phage repressor  50.41 
 
 
255 aa  267  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  27.41 
 
 
258 aa  95.9  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2342  transcriptional regulator, XRE family  32.06 
 
 
279 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000474992  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0655  putative phage repressor  36.31 
 
 
277 aa  85.9  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.119193  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  25.69 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  28.08 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2028  transcriptional regulator, XRE family  31.79 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  22.22 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1968  XRE family transcriptional regulator  22.75 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749676  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  32.02 
 
 
209 aa  55.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0272  transcriptional regulator, putative  24.19 
 
 
210 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  24.67 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  24.17 
 
 
219 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  28.72 
 
 
284 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  37.66 
 
 
261 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  26.22 
 
 
216 aa  48.9  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  24.89 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  24.24 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  24.24 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  22.35 
 
 
206 aa  45.4  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  27.16 
 
 
230 aa  45.4  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  26.61 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  21.83 
 
 
229 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  31.82 
 
 
222 aa  42.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>