27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0420 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0420  CI repressor  100 
 
 		 116 aa  241  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  43.53 
 
 		 232 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0868  putative phage repressor  50.79 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0373508  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2949  DNA-binding protein, putative  45 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  43.75 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3355  hypothetical protein  44.93 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.791337  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  45.16 
 
 		 219 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  42.03 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2707  putative PAS/PAC sensor protein  37.7 
 
 		 640 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  37.1 
 
 		 209 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1994  putative PAS/PAC sensor protein  33.87 
 
 		 543 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199074  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00833  hypothetical protein  28.87 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0911  putative bacteriophage CI repressor protein  28.87 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000321718  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1586  putative PAS/PAC sensor protein  35.94 
 
 		 541 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.822014  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00817  Repressor protein  28.87 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.392805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2793  CI repressor  29.03 
 
 		 189 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.0967608 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  41.54 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  28.77 
 
 		 211 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1712  CI repressor  33.9 
 
 		 212 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0120781  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1732  bacteriophage CI repressor  34.29 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000144956  normal  0.557146 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  28.21 
 
 		 229 aa  43.5  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1342  bacteriophage CI repressor  31.15 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453655  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4133  transcriptional regulator-related protein  32.86 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  28.81 
 
 		 236 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0883  CI repressor  29.69 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0163  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1287  CI repressor  33.33 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>