50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2676 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  100 
 
 		 231 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  78.45 
 
 		 232 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2949  DNA-binding protein, putative  74.46 
 
 		 231 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0868  putative phage repressor  55.22 
 
 		 242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0373508  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  27.16 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  28.23 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  26.54 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0420  CI repressor  43.75 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  28.51 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  26.89 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  27.62 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1712  CI repressor  26.11 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0120781  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  26.07 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  26.07 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  25.62 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3355  hypothetical protein  41.27 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.791337  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  30.38 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1230  hypothetical protein  36.23 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.384901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  23.58 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  24.8 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  28.45 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1321  hypothetical protein  39.71 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  27.21 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2707  putative PAS/PAC sensor protein  37.29 
 
 		 640 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109569 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  24.78 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  25.86 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  23.14 
 
 		 284 aa  48.5  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  22.41 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1994  putative PAS/PAC sensor protein  37.1 
 
 		 543 aa  48.5  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199074  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  26.8 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  28.41 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  27.27 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  24.68 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1586  putative PAS/PAC sensor protein  37.29 
 
 		 541 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.822014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  22.52 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  30.58 
 
 		 265 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  27.27 
 
 		 240 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  36.84 
 
 		 238 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  25 
 
 		 256 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  22.07 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  28.18 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  22.07 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1287  CI repressor  33.9 
 
 		 128 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  26.14 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0804  hypothetical protein  29.21 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00564078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  26.97 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  31.52 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  31.91 
 
 		 216 aa  42  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  27.66 
 
 		 216 aa  42  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>