32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2949 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2949  DNA-binding protein, putative  100 
 
 		 231 aa  480  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  74.46 
 
 		 231 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  72.22 
 
 		 232 aa  358  4e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0868  putative phage repressor  52.59 
 
 		 242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0373508  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  29.52 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  30.43 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  28.51 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0420  CI repressor  45 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  26.14 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  27.51 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  29.57 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  26.05 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3355  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.791337  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1712  CI repressor  24.26 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0120781  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1230  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.384901  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  27.9 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  26.56 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1321  hypothetical protein  39.71 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  26.56 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  21.3 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2707  putative PAS/PAC sensor protein  38.98 
 
 		 640 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109569 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  23.14 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  25 
 
 		 284 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1586  putative PAS/PAC sensor protein  38.98 
 
 		 541 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.822014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  24.79 
 
 		 230 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1994  putative PAS/PAC sensor protein  35.71 
 
 		 543 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199074  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  32.39 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  24.49 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1287  CI repressor  32.26 
 
 		 128 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  23.5 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1732  bacteriophage CI repressor  24.59 
 
 		 125 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000144956  normal  0.557146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>