26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1732 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1732  bacteriophage CI repressor  100 
 
 		 125 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000144956  normal  0.557146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4133  transcriptional regulator-related protein  96.8 
 
 		 125 aa  244  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3705  CI repressor  83.33 
 
 		 126 aa  217  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1859  CI repressor  60.83 
 
 		 128 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00836044  normal  0.0132709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04120  transcriptional regulator  44.07 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0804  hypothetical protein  45 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00564078  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1615  hypothetical protein  37.29 
 
 		 174 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  30.67 
 
 		 236 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0420  CI repressor  34.29 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1994  putative PAS/PAC sensor protein  38.6 
 
 		 543 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  29.51 
 
 		 235 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1427  CI repressor  36.67 
 
 		 240 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1269  bacteriophage CI repressor  32.26 
 
 		 233 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0163  transcriptional regulator, XRE family  23.2 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0877  CI repressor  33.33 
 
 		 288 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.277312  normal  0.131119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1230  hypothetical protein  27.94 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.384901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  25.81 
 
 		 230 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2707  putative PAS/PAC sensor protein  40.68 
 
 		 640 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0700  bacteriophage CI repressor  36.67 
 
 		 255 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2949  DNA-binding protein, putative  24.59 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  38.71 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1586  putative PAS/PAC sensor protein  37.29 
 
 		 541 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.822014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  31.67 
 
 		 284 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0868  putative phage repressor  29.49 
 
 		 242 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0373508  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  32.1 
 
 		 232 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  32.26 
 
 		 229 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>