47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0868 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0868  putative phage repressor  100 
 
 		 242 aa  502  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0373508  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  55.65 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  52.61 
 
 		 232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2949  DNA-binding protein, putative  53.02 
 
 		 231 aa  248  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  26.18 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0420  CI repressor  50.79 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  29.17 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  26.14 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  23.68 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  25.56 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  26.5 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3355  hypothetical protein  41.27 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.791337  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1712  CI repressor  27.73 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0120781  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  24.56 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  24.02 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1230  hypothetical protein  35.9 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.384901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  24.02 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  24.36 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1321  hypothetical protein  38.24 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2707  putative PAS/PAC sensor protein  36.67 
 
 		 640 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109569 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1586  putative PAS/PAC sensor protein  38.33 
 
 		 541 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.822014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  24.05 
 
 		 270 aa  48.9  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  24.5 
 
 		 235 aa  48.5  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  23.55 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1994  putative PAS/PAC sensor protein  33.87 
 
 		 543 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  22.52 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  21.92 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  21.93 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  22.27 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  23.5 
 
 		 284 aa  45.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  23.28 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  28.26 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  28.26 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  23.48 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  24.77 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  23.6 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  35.38 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  25.33 
 
 		 243 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  21.86 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  27.17 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  21.97 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  22.17 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  26.09 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  21.46 
 
 		 214 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1732  bacteriophage CI repressor  30.38 
 
 		 125 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000144956  normal  0.557146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  28.09 
 
 		 230 aa  41.6  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>