180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0189 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  100 
 
 		 211 aa  436  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  50.47 
 
 		 219 aa  221  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  45.41 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  41.54 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  44.19 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  43.67 
 
 		 236 aa  174  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  39.91 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  37.18 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  39.72 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  27.7 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  29.09 
 
 		 235 aa  99.8  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  28.57 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  30.29 
 
 		 264 aa  89.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  30.29 
 
 		 264 aa  89  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  25.34 
 
 		 247 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  35.71 
 
 		 270 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1712  CI repressor  30.05 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0120781  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  24.43 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  33.82 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  32.14 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  33.58 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  28.3 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  35.71 
 
 		 244 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  28.33 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  30.13 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  28.67 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2949  DNA-binding protein, putative  26.14 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  30.15 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  31.45 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  24.34 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  28.5 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  29.38 
 
 		 247 aa  72  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  26.81 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  26.89 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  25.94 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  27.23 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  33.57 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  33.57 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  26.06 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  31.53 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  29.03 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  31.93 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  26.06 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  27.41 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  29.63 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3355  hypothetical protein  41.43 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.791337  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  24.66 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  28.06 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  28.37 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  23.38 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  22.87 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  24.88 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  30.51 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  23.76 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  24.15 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0868  putative phage repressor  23.58 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0373508  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0805  conserved hypothetical protein, putative peptidase S24  24.27 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  25.81 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  28.24 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  25.89 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  26.67 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  27.86 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  25 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  25 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  28.38 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  22.91 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  26.22 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  34.72 
 
 		 144 aa  52.4  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  23.75 
 
 		 256 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  24.03 
 
 		 241 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  23.33 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  23.36 
 
 		 263 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13403  hypothetical protein  24.67 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  26.72 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  32.17 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  30.28 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  27.61 
 
 		 252 aa  49.3  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  28.15 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  32 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1342  bacteriophage CI repressor  23.44 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453655  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0420  CI repressor  28.77 
 
 		 116 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  27.17 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  27.78 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  25.69 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  25.85 
 
 		 243 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1150  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  28.57 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00833  hypothetical protein  21.54 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  30.39 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  30.39 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  25.85 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  24.31 
 
 		 284 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  30.39 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  30.39 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  30.39 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>