95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3211 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  35.65 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  35.56 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  35.11 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  32.44 
 
 		 240 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  32.89 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  35.75 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  41.33 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  34.84 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  33.19 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  35.27 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  33.74 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  30.95 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  39.46 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  37.41 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  35.37 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  34.9 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  30.99 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  32.65 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  36.91 
 
 		 270 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  30.13 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  29.71 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  34.23 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  30.73 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  27.31 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  34.95 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  34.95 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  28.63 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  41.76 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  27.22 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  34.85 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  31.82 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  32.26 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  27.19 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  33.09 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  35.34 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  30.66 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  30.5 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  36.84 
 
 		 289 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  36.84 
 
 		 289 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000855833  hitchhiker  0.0000527672 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  31.39 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  30.26 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  29.85 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  23.97 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  26.45 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  31.43 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  31.16 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  32.87 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  27.59 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  31.69 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  23.68 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  28.16 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  41.67 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131906  hitchhiker  0.000000754842 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  31.54 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  25.22 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  27.81 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  27.27 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  26.52 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  26.95 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  37.5 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  28.14 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  28.57 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  38.98 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  26.51 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  39.19 
 
 		 421 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  27.11 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  31.48 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  28 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  30.61 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  28.21 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  30.37 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  30.37 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  28.15 
 
 		 211 aa  49.7  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  26.12 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  27.34 
 
 		 193 aa  48.5  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0537  transcriptional regulator, putative  32.35 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  27.4 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0576  hypothetical protein  32.35 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664353  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  24.44 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  31.9 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  23.24 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0582  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  25.79 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  28.68 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0666  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0895819  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  22.32 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  29.03 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 248 aa  42  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  33.67 
 
 		 205 aa  42  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>