11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0666 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0666  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  299  8.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0895819  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  37.84 
 
 		 289 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000855833  hitchhiker  0.0000527672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  37.84 
 
 		 289 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  42.03 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  47.06 
 
 		 289 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131906  hitchhiker  0.000000754842 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  35.48 
 
 		 421 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  39.44 
 
 		 224 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1024  gp52  34.78 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1431  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000064754  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  33.33 
 
 		 248 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1810  hypothetical protein  35.06 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>