128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0710 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  100 
 
 		 238 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  55.27 
 
 		 236 aa  255  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  50.44 
 
 		 225 aa  221  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  43.89 
 
 		 229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  37.18 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  36.05 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  36.99 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  35.19 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  33.61 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  31.9 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  29.58 
 
 		 248 aa  95.9  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  28.46 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  29.61 
 
 		 249 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  37.86 
 
 		 270 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  28.05 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  30.8 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  30.43 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  27.85 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  26.34 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  28.69 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  30.64 
 
 		 204 aa  72  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  27.27 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  32.62 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  28.75 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  26.97 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  28.87 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  27.87 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  26.97 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  27.12 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  27.46 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  25 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  26.56 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  34.81 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  28.12 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  34.81 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  27.68 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  26.25 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  30.48 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  26.58 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  33.08 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  23.85 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  29.93 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  29.65 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  28.45 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  25.21 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  30.56 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  28.02 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  27.65 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  33.83 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  26.47 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  25.65 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  27.62 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  28.57 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  21.94 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  23.68 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  32.03 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  33.33 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  32.28 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  25.7 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  26.29 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  30.88 
 
 		 147 aa  52.8  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  29.32 
 
 		 292 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  32.31 
 
 		 289 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  25.62 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  31.53 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  26.12 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  29.08 
 
 		 151 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  23.66 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3391  putative prophage repressor  28.26 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711365  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  23.77 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  24.7 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  21.67 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  23.93 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  23.73 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  36.63 
 
 		 217 aa  49.3  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  26.67 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  28.66 
 
 		 237 aa  48.5  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  23.21 
 
 		 241 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  29.2 
 
 		 143 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  32.14 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0962  DNA-binding protein  32.89 
 
 		 179 aa  48.5  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0340549  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  22.18 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  20.42 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  20.42 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  23.66 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  25.99 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  24.32 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4270  hypothetical protein  41.67 
 
 		 232 aa  45.8  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  36.52 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  36.84 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.71 
 
 		 213 aa  45.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  32.98 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>