54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4549 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  100 
 
 		 231 aa  475  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4500  putative phage repressor  43.04 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  43.31 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  31.9 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  31.03 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  28.93 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  31.82 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  30.36 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  38.46 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  37.93 
 
 		 292 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  31.4 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  38.98 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  37.18 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  29.13 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  27.91 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  40.62 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  26.85 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  31.3 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  35.63 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  27.07 
 
 		 243 aa  48.9  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  32.91 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  27.4 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  32.14 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  29.63 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  29.63 
 
 		 230 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  25.96 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 219 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  29.63 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  29.86 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  33.33 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  23.66 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  34.72 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  34.72 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  30.36 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  29.13 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  23.89 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  30.53 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  33.33 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  23.88 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  29.33 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  28.42 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  30.86 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  37.84 
 
 		 289 aa  42.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  34.78 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  26.21 
 
 		 205 aa  42  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  26.73 
 
 		 237 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  36.84 
 
 		 230 aa  41.6  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  32.14 
 
 		 225 aa  41.6  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>