202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0740 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  100 
 
 		 240 aa  493  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  94.14 
 
 		 240 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  79.4 
 
 		 233 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  78.97 
 
 		 233 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  78.11 
 
 		 233 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  70.61 
 
 		 229 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  71.05 
 
 		 229 aa  361  4e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  70.61 
 
 		 229 aa  353  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  66.82 
 
 		 225 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  59.74 
 
 		 230 aa  288  6e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  56.78 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  55.17 
 
 		 263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  45.38 
 
 		 237 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  45.38 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  42.29 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  39.66 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  39.66 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  40.32 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  39.51 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  40.32 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  42.25 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  49.33 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  38.86 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  32.77 
 
 		 243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  32.77 
 
 		 243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  33.76 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  30.96 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  32.89 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  33.76 
 
 		 214 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  34.06 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  31.03 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  32.64 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  32.91 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  29.05 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  30.08 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  56.92 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  56.92 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  27.71 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0576  hypothetical protein  27.97 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664353  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  52.24 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  53.12 
 
 		 135 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0537  transcriptional regulator, putative  27.85 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  32.09 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  53.12 
 
 		 135 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  26.69 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08220  DNA-binding protein RDGA  30 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  25.22 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  29.91 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  29.31 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  26.22 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0582  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794333 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  44.93 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  28.75 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  50 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  32.5 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  32.33 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  37.4 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  28.15 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  27.16 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  27.51 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  33.33 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  33.33 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  26.18 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  29.93 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  29.63 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  26.87 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  32.16 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  36.36 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  27.07 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  33.09 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  25.62 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  26.12 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  30.61 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  25.88 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1163  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  26.38 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  25.58 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  29.32 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  39.39 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  28.57 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  27.18 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  29.61 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  27.24 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 380 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  26.64 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  25 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  34.92 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  41.67 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 152 aa  52.4  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  34.13 
 
 		 263 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  26.27 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  25.91 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  39.39 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>