188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2959 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  100 
 
 		 193 aa  393  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  62.68 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  47.55 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  47.55 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  41.44 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  38.29 
 
 		 284 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  42.75 
 
 		 248 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  38.03 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  40.43 
 
 		 233 aa  86.3  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  38.19 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  38.19 
 
 		 264 aa  86.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  44.26 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  39.16 
 
 		 247 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  38.03 
 
 		 247 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  36.17 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  43.88 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  36.36 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  33.57 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  32.54 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  35.88 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  35.42 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  33.53 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  28.67 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  30.43 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  34.93 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  31.72 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  32.89 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  34.85 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  32.89 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 219 aa  72  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  34.67 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  32.85 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  30.3 
 
 		 244 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  34.81 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  32.14 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  33.33 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  32.64 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  33.1 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  30.36 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  33.57 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  32.16 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  32.88 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  35.34 
 
 		 264 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  28.87 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  32.33 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  29.93 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  32.62 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  31.43 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  30.5 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  30.18 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  33.1 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5381  prophage MuMc02, S24 family peptidase  54 
 
 		 51 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.381026 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1678  putative phage repressor  36 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  35.25 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  30.93 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  34.88 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2520  LexA repressor  36.64 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0774546  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  34.51 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  34.29 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  30.72 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2425  LexA repressor  37.5 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  35.25 
 
 		 256 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  30.34 
 
 		 240 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3976  prophage MuMc02, S24 family peptidase  41.38 
 
 		 57 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.275269 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0272  transcriptional regulator, putative  23.68 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  35.25 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  30.94 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  30.28 
 
 		 819 aa  52.4  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  29.73 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  27.89 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2601  LexA repressor  35.11 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2792  LexA repressor  35.11 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147289  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  30.22 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  30.94 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2741  LexA repressor  36.7 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3116  LexA repressor  35.11 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  39.36 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4367  hypothetical protein  23.02 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  0.0748532 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  32.1 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  32.85 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  30.94 
 
 		 240 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  30.66 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  31.43 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  31.65 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  30.66 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  32.37 
 
 		 229 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  27.34 
 
 		 248 aa  48.5  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  33.33 
 
 		 238 aa  48.5  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  25 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  33.83 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1395  putative phage repressor  25.67 
 
 		 239 aa  48.5  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>