More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2425 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2425  LexA repressor  100 
 
 
205 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2741  LexA repressor  90.73 
 
 
205 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2601  LexA repressor  90.73 
 
 
205 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3116  LexA repressor  91.09 
 
 
202 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3152  LexA repressor  67.65 
 
 
205 aa  276  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2520  LexA repressor  67.8 
 
 
205 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0774546  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2792  LexA repressor  66.34 
 
 
202 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147289  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02088  LexA repressor  57.71 
 
 
201 aa  224  7e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1475  LexA repressor  51.69 
 
 
211 aa  192  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.457406 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00150  LexA repressor  51.2 
 
 
213 aa  189  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0099  LexA repressor  46.86 
 
 
211 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0085  LexA repressor  46.86 
 
 
211 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00110389  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  48.74 
 
 
201 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2297  LexA repressor  47.03 
 
 
202 aa  171  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0763769  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2152  LexA repressor  46.08 
 
 
204 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3510  LexA repressor  45.54 
 
 
202 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9651  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3599  LexA repressor  45.05 
 
 
202 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0155169  normal  0.533875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25160  LexA repressor  45.59 
 
 
204 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2143  LexA repressor  45.05 
 
 
202 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1683  LexA repressor  45.05 
 
 
202 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141699  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1587  LexA repressor  46.08 
 
 
204 aa  168  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3565  LexA repressor  43.44 
 
 
224 aa  167  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173958  hitchhiker  0.00714221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2008  LexA repressor  44.39 
 
 
218 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196928  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1630  LexA repressor  43.87 
 
 
216 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1659  LexA repressor  45.05 
 
 
202 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3283  LexA repressor  45.05 
 
 
202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0200  LexA repressor  42.79 
 
 
206 aa  165  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2471  LexA repressor  43.87 
 
 
216 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.643159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1179  LexA repressor  44.81 
 
 
216 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865174  normal  0.239395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3872  LexA repressor  44.06 
 
 
202 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315226  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1772  LexA repressor  43.4 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2558  LexA repressor  43.38 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.031889  normal  0.0134465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0127  LexA repressor  42.79 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1240  LexA repressor  44.34 
 
 
216 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0593225  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2481  LexA repressor  44.34 
 
 
235 aa  162  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147016  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1832  transcriptional repressor, LexA family  47.5 
 
 
207 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000994173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2954  LexA repressor  42.52 
 
 
234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14510  LexA repressor  42.57 
 
 
202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2012  LexA repressor  44.34 
 
 
235 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1496  LexA repressor  43.13 
 
 
215 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  41.29 
 
 
206 aa  161  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0356  LexA repressor  44.55 
 
 
215 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0456826  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1211  LexA repressor  44.55 
 
 
215 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272184  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1699  LexA repressor  44.55 
 
 
215 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.465061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1859  LexA repressor  44.55 
 
 
215 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349783  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1866  LexA repressor  43.72 
 
 
225 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.306175  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1845  LexA repressor  44.55 
 
 
215 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0805  LexA repressor  44.55 
 
 
215 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4738  LexA repressor  43.13 
 
 
215 aa  160  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483588  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1516  LexA repressor  43.13 
 
 
215 aa  160  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984097  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1637  LexA repressor  42.65 
 
 
215 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1577  LexA repressor  42.65 
 
 
215 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1120  LexA repressor  42.65 
 
 
215 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1600  LexA repressor  42.65 
 
 
215 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1304  LexA repressor  44.34 
 
 
216 aa  158  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3481  LexA repressor  42.57 
 
 
207 aa  158  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2994  LexA repressor  42.47 
 
 
224 aa  158  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.487407  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  41.09 
 
 
205 aa  158  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  41.92 
 
 
211 aa  157  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1918  LexA repressor  42.06 
 
 
234 aa  157  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726734  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1483  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.78 
 
 
261 aa  156  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.639619  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0418  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.27 
 
 
239 aa  156  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000022739  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  41.29 
 
 
202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  41.29 
 
 
202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  41.29 
 
 
202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  41.29 
 
 
202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  41.29 
 
 
202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2007  LexA repressor  42.29 
 
 
202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.417718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0180  LexA repressor  40.49 
 
 
205 aa  154  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  41.29 
 
 
202 aa  154  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.29 
 
 
202 aa  154  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  41.29 
 
 
202 aa  154  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  41.29 
 
 
202 aa  154  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0247  LexA repressor  40.3 
 
 
202 aa  154  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0945075  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  41.29 
 
 
202 aa  154  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  41.29 
 
 
202 aa  154  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  41.29 
 
 
202 aa  154  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  41.29 
 
 
202 aa  154  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  41.29 
 
 
202 aa  154  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1981  LexA repressor  41.59 
 
 
218 aa  154  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0274768 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2310  LexA repressor  41.1 
 
 
224 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.389414  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0426  transcriptional repressor, LexA family  39.38 
 
 
239 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1549  LexA repressor  41.1 
 
 
224 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4912  LexA repressor  40.45 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2636  LexA repressor  41.01 
 
 
227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.270851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0733  LexA repressor  40.8 
 
 
202 aa  151  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1741  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.13 
 
 
226 aa  151  7e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4460  LexA repressor  40.8 
 
 
202 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1868  LexA repressor  43.35 
 
 
205 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3524  LexA repressor  40.3 
 
 
203 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3860  LexA repressor  40.8 
 
 
202 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.528638  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1300  LexA repressor  40.8 
 
 
202 aa  149  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2423  LexA repressor  39.02 
 
 
209 aa  149  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2082  LexA repressor  39.37 
 
 
231 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3770  LexA repressor  40.8 
 
 
202 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.638288  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1543  transcriptional repressor, LexA family  43.35 
 
 
205 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00734536 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0386  LexA repressor  37.2 
 
 
210 aa  149  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0514  LexA repressor  40.3 
 
 
202 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1096  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.16 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0403674  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3398  LexA repressor  39.8 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>