More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p320_13 on replicon NC_011314
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  100 
 
 
205 aa  418  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  43.4 
 
 
231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  37.8 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  35.34 
 
 
263 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  34.82 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  34.82 
 
 
229 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  34.06 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  31.62 
 
 
233 aa  111  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  34.43 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  32.05 
 
 
233 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  31.62 
 
 
233 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  31.03 
 
 
240 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  31 
 
 
240 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  33.18 
 
 
214 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  31.76 
 
 
243 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  32.89 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  29.84 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08220  DNA-binding protein RDGA  26.77 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  29.8 
 
 
259 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  31.74 
 
 
237 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  35.16 
 
 
206 aa  87.8  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  31.74 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  29.2 
 
 
244 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  30.94 
 
 
225 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  28.7 
 
 
243 aa  85.1  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  27.62 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  27.62 
 
 
256 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  25.97 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  26.69 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  29.58 
 
 
227 aa  79  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  24.19 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  28.9 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  37.31 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  29 
 
 
230 aa  74.7  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  28.7 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  24.77 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  27.05 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  29.21 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  25.69 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  26.05 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  29.35 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  31.3 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  25.11 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  26.29 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  24.05 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  30.22 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  27.8 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  25.63 
 
 
219 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  32.82 
 
 
235 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  24.32 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  23.85 
 
 
238 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  32.62 
 
 
193 aa  62.8  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  25 
 
 
219 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  31.39 
 
 
248 aa  61.6  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  32.37 
 
 
247 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  32.37 
 
 
247 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  29.57 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.63 
 
 
245 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.63 
 
 
245 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  29.2 
 
 
246 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  23.38 
 
 
211 aa  59.3  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  33.7 
 
 
247 aa  59.3  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  23.94 
 
 
235 aa  58.9  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
115 aa  58.5  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
115 aa  58.5  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  24.6 
 
 
216 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 
262 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  42.37 
 
 
262 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  42.37 
 
 
262 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  42.37 
 
 
262 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  26.32 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  27.74 
 
 
236 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
135 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  22.71 
 
 
302 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  26.67 
 
 
244 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  27.08 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  23.43 
 
 
270 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
163 aa  55.5  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  25.74 
 
 
248 aa  55.5  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  27.84 
 
 
204 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 
322 aa  55.1  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  27.57 
 
 
196 aa  54.7  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  30.23 
 
 
261 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  27.78 
 
 
263 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  39.77 
 
 
122 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  25.64 
 
 
244 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  32.63 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  38.37 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  38.37 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  27.63 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  23.41 
 
 
239 aa  52.8  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  28.47 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  22.58 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  37.5 
 
 
114 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  37.5 
 
 
114 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  23.75 
 
 
239 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  23.19 
 
 
200 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 
152 aa  52  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>