229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3317 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  521  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  95.04 
 
 		 262 aa  498  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  91.6 
 
 		 262 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  95.42 
 
 		 262 aa  475  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  31.02 
 
 		 328 aa  88.6  9e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  29.5 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  26.05 
 
 		 364 aa  82.4  0.000000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  53.97 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  45.21 
 
 		 146 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  53.03 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  46.03 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 395 aa  69.3  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  49.21 
 
 		 200 aa  67  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  35.4 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  47.62 
 
 		 459 aa  66.2  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  27.59 
 
 		 149 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  40.3 
 
 		 149 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  29.05 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  40.54 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  41.79 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  29.05 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  41.27 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  43.08 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  40.3 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 176 aa  62  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  26.36 
 
 		 320 aa  62  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 134 aa  61.6  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 163 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  41.94 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  33.94 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  43.48 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  43.08 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  43.08 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  35.53 
 
 		 374 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  35.53 
 
 		 374 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  35.53 
 
 		 374 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  35.53 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  37.5 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  38.16 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  39.68 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  43.75 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  42.37 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  36.51 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 142 aa  57  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  47.17 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  43.66 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  42.11 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  42.86 
 
 		 436 aa  55.8  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  43.1 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 380 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 204 aa  54.7  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  36.23 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 231 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 115 aa  52.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 115 aa  52.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 206 aa  52.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 127 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 115 aa  52.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  39.71 
 
 		 122 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 104 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 370 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 368 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  34.88 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0134  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 104 aa  52  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 115 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  39.71 
 
 		 122 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 131 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 95 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>